2012年3月13日火曜日

DNA抽出

実験

DNA抽出(マウスの尾から)

試薬

1M Tris-HCl (pH8.0, 100ml) 1M Tris-HCl (pH7.5, 100ml)
  • Tris 12.11g
  • HCl 4.2ml (pH8), 6.5ml (pH7.5)
  • milliQ 100mlくらい
  • TrisをmilliQ(約80ml)に溶かす
  • HClをpHが既定の値に達するまで加える
  • milliQを100mlまで加えてメスアップ
  • オートクレーブ

0.5M EDTA (100ml)
  • Na2EDTA.2H2O 18.61g
  • NaOH pellet 約2g
  • milliQ 100ml (だいたい)
  • pHが8になるまでNaOH pelletを加える(EDTAはpH8以下では溶けない)
  • milliQでメスアップ

10% SDS (sodium dodecyl sulfate, 100ml)
  • electrophoresis grade SDS 10g
  • milliQ 100ml (less)
  • milliQ90mlにSDSを加える
  • 容器を65度のウォータプールに入れる
  • 溶けたらmilliQでメスアップ
  • オートクレーブは駄目

TE (50ml, ファルコンチューブ)
  • 1M Tris-HCl(pH8.0) 500μl
  • 0.5M EDTA 10μl
  • D.W.でメスアップ

TBS 50ml
  • 50mM Tris-Cl (pH7.4-8.0) 2.5ml
  • 100mM NaCl 1ml
  • 5mM EDTA 0.5ml

Lysis buffer(11.2ml+α)
  • TBS 11.2ml
  • 10%SDS 560ul
  • ProteinaseK 112ul

手順
  1. マウスの尾を5mm~1cmカットし、個体ごとにチューブに入れる
  2. 各チューブにLysis Bufferを400ulずつ入れる
  3. 55度インキュベータでオーバーナイトで溶かす
  4. (クロロホルム処理)
  5. 各チューブに100%エタノールを500ulずつ入れる(少し混ぜる)
  6. 遠心する(15000rpm、10分)
  7. エタノールを取り除き、70%エタノールを入れて洗う
  8. 遠心(15000rpm、5分)
  9. エタノールをできる限り取り除く
  10. フラッシュ遠心
  11. エタノールを完全に取り除き、TEを100ul入れる
  12. 37度インキュベータでDNAをTEに溶かす

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